| Forklar kort hvad hydroxypropionat cyklus går ud på hvem bruger denne til co2 fiksering? | CO2 fikseres pa acetyl-CoA og produktet er glyoxylate, som kan omdannes til cellemateriale → ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
Grønne non-svovl bakterier |
| Forklar kort hvad hydroxypropionat cyklus går ud på hvem bruger denne til co2 fiksering? | CO2 fikseres pa acetyl-CoA og produktet er glyoxylate, som kan omdannes til cellemateriale → ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
Grønne non-svovl bakterier |
| Forklar kort hvad hydroxypropionat cyklus går ud på hvem bruger denne til co2 fiksering? | CO2 fikseres pa acetyl-CoA og produktet er glyoxylate, som kan omdannes til cellemateriale → ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
Grønne non-svovl bakterier |
| Forklar kort hvad hydroxypropionat cyklus går ud på hvem bruger denne til co2 fiksering? | CO2 fikseres pa acetyl-CoA og produktet er glyoxylate, som kan omdannes til cellemateriale → ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
Grønne non-svovl bakterier |
| Giv eksempel på en enterotoxin udsendende bakterie: | Eks. Vibrio cholerae - trækker mere vand i tyktarmen = tynd mave |
| Giv eksempel på en enterotoxin udsendende bakterie: | Eks. Vibrio cholerae - trækker mere vand i tyktarmen = tynd mave |
| Giv eksempel på en enterotoxin udsendende bakterie: | Eks. Vibrio cholerae - trækker mere vand i tyktarmen = tynd mave |
| Forklar hvad binær fission er | aseksuel reproduktion. vokser i længden. Septum/FtsZ ring i midten. Celler samme størrelse ved seperation |
| Forklar hvad knopskydning er | polar voksning. Dattercelle mindre ved afsnørring. |
| Hvad betyder generationstid? og giv to eksempler på forskellig generationstid | tid det tager for en celle at blive til to (en celledeling)
o E. coli - 20 min
o Desulfobacter (sulfatreducerende bakterie) ca. 1 dag
Afhænger af næringstilgængelighed |
| Hvad er en batchkultur i forhold til næring? | Kulturen er afgrænset- der er en bestemt mængde medie til rådighed, når det er brugt op dør kulturen |
| Hvad er en kemostat? (i forhold til vækstmedie) | nyt vækst medie kommer hele tiden ind i kulturen og affaldsstoffer kommer hele tiden ud (Kan holdes i den eksponentielle vækstfase) |
| Hvilken type vækst vokser bakterier med og angiv formel her på? | eksponentiel
N(t)=N_0*e^(kt) |
| Hvilke 4 faser gennemgår bakterierne i en batchkultur? | 1. Lagfase (ingen celledeling. Akklimatisering)
2. Eksponentiel fase (Cellerne deler sig)
3. Stationære fase (Celledeling modsvarer antal celler der dør = stionær)
4. Dødsfase (dør flere end der kommer nye bakterier) |
| Hvilke metoder brugte vi i lab til at kvantificerer bakterierne? | • OD (spektrofotometri - måler både levende og døde celler, kan ikke bruges til at måle dødsfasen)
• Direct cell count (Burker-Türk plade - tæller ALLE celler, levende og døde - morfologi er synlig)
• CFU (Colony forming units på agarpladen. Kun levende celler danner kolonier - alle 4 faser kan måles) |
| Hvad hedder det på smart at alle bakterier ikke kan kultiveres? | ”The great plate count anomaly” |
| Hvad betyder phychrophile? | Tåler meget lave temperature |
| Hvad betyder mesophile? | Tåler temp midt i mellem (10-45℃) →HUSK meso=midt i mellem |
| Hvad betyder thermophile? | (40-70℃) → Husk varmeelskende |
| Hvad betyder hyperthermophile | (70-100℃) → Husk mere varmeelskende |
| Hvad gør hyperthermophile for at kunne holde til disse temperature? | Termostabile proteiner, DNA stabilitet og flere mættede fedtsyrer |
| Hvad gør psychrophile for at kunne holde til så lave temp? | Flere umættede fedtsyrer og akkumulering af salte for at undgå at fryse og opretholde flydende membran |
| Hvilke tre typer af vækstbetingelser er der inden for pH | o Acidophile = pH ved 0,5-5
o Neutrophile = pH ved 4,5-8
o Alkaliphile = pH ved 7-11 |
| Hvilke 4 typer af vækstbetingelser er der indenfor salinitet? | o Nonhalophile (tolerer ikke salt
o Halotolerant (tolerer salt, men kan vokse uden salt))
o Halophile (kræver noget salt for at kunne vokse (eks. saltvand)
o Extreme halophile |
| Hvad betyder det at være fakulativ anerob? | kan både vokse med og uden ilt |
| Hvilke tre typer af vækstbetingelser er der inden for tryk | o Barotolerante (tolerer højt tryk)
o Barophile (vokser bedst ved højt tryk) - eks. under havet
o Extreme Barophile |
| Hvilke to typer DNA har prokaryoter og hvad er forskellen på diss? | Kromosom → cirkulært, koder for metabolisme. Typisk en kopi
Plasmid → cirkulært, koder for ikke essentielle funktioner (resistens, toxiner mm.), ofte flere kopier |
| Hvad betyder homolog recombination? | Recombination = udveksling af genetisk materiale mellem to DNA molekyler (smart med genetisk variation når repoduktion sker aseksuelt)
Homolog = det genetiske materiale ligner hinanden og har lignende gener - næsten identiske basepar |
| Forklar kort de 3 genudvekslingsmekansimer der er for prokaryotes: | 1. Konjugation = plasmid overførsel mellem donor og modtager celle.
2. Transformation = optager ”nøgent” DNA direkte fra det omgivende miljø
3. Tranduktion = virus-medieret genudveksling |
| Forklar hvordan konjugation foregår: | 1. Fysisk kontakt mellem to bakterier via. pili donor cellens pilus genkender receptor på modtagercellen)
2. Der dannes en konjugations pore = kanal, hvor selve DNA overføres ved mekanismen rolling circle replication → “nick” i plasmidet hvorefter et strand overføres til modtager celle og der replikeres samtidig med at der også replikeres i donor cellen → begge celler ender med at indeholde plasmidet |
| Hvad er plasmid DNA konjugation? | F+ celle og F- celle → to F+ celler. Hele plasmidet overføres til modtager cellen og herved bliver modtagercellen også en donor celle |
| Hvad er kromosom DNA konjugation? | Hfr = celle hvor F^+ generne fra plasmidet sidder i det kromosomale DNA.
Hfr celle og F- celle → Hfr celle og F- celle.
Her bliver noget af kromosomet også overført til modtagercellen fordi det hænger sammen med plasmidet. Ofte vil DNA strengen knække under overførsel til modtagercellen hvorved kun noget af donorkromosomet vil blive integreret i modtagercellen. Derfor bliver modtagercellen heller ikke til Hfr celle eller F+ celle. Her sker homolog recombination, |
| Forklar Transformation mere i dybden: | • Kræver DNA bindende proteiner på ydersiden af bakterien
• Kan binde dsDNA, men optager kun ssDNA
• recA proteinet binder til donorDNA og indsætter det i plasmidet i modtager cellen |
| Hvad er forskellen på generel transduktion og specialiseret transduktion? | -----Generel transduktion: Vilkårlig værts kromosom stykker pakkes i viras proteinkapsler som følge af en pakningsfejl. Kaldes transducing particle → det meste af vira er funktionsdygtigt
------ Specialiseret transduktion: Nogle af værtens gener pakkes sammen med viras genom i kapsiderne, som følge af en fejl i udskæring af prophag fra værtens genom. → både Vira DNA og den oprindelig værts DNA kan inkorporeres i den ny-inficerede bakterie → recombination → represser gener undertrykkes eller muligvis mistes. Attachments regions for DNA polymerase mistes |
| Hvad definerer en virus? | snyltende arvemateriale (RNA eller DNA), med virion stadie, der kan overtage kontrollen over en værtscelle og dermed producerer kopier af sig selv. Virus = obligate parasitter |
| Er virus obligate parasitter? | Jep |
| Hvad menes der med vorion stadie? | (extracellulære form) = Beskyttet af et protein lag kaldet kapsid → Virus bevæger sig fra en vært til en anden |
| Hvilke to typer af udseende kan virus have? | Nøgen virus → arvemateriale omsluttet af proteinkapsel (=kapsid)
Kappeklædt virus → arvemateriale omsluttet af proteinkapsel (=kapsid) + fosfolipid dobbeltmembran. Identisk med værtscellens |
| Hvad er fordelen ved at være en kappeklædt virus? | Indsluttet en dobbeltmembran identisk med værten, hvilket camouflere vira |
| Hvilke type gener indeholder vira for det meste? | Ikke mange, men gener nødvendige for "egen" overlevelse. eks.
- revers transkripase
- til inficering af en bakterie
- capsomal protein - protein der er med til at danne proteinkapslen rundt om
- Lyserende enzymer |
| Forklar kort virus livscyklus: | 2 primære stadier - spredning og reproduktion |
| Forklar kort det lytiske livsstadie: | 1. Vira binder til host cellen
2. viral DNA indsprøjtes i host cellen
3. Der sker replikation af DNA/RNA og translation til proteiner
4. Nyt DNA/RNA pakkes
5. Cellen lyserer og vira spredes på ny |
| Forklar kort det lysogene livsstadie: | Følger:
1. Vira binder til host cellen
2. viral DNA indsprøjtes i host cellen
2.1 Virus DNA integreres i værtens genom og kan blive der under celle deling
3. Der sker replikation af DNA/RNA og translation til proteiner
4. Nyt DNA/RNA pakkes
5. Cellen lyserer og vira spredes på ny |
| Hvilken stadie er vira på, hvis der er få værter? | Lysogene stadie |
| Hvordan beskytter værten sig mod virus infektion? | 1. CRISPR
2. Restriktionsenzymer |
| Hvordan beskytter virus sig mod værtens forsvar? | 1. glycolysering eller methylering af virus DNA så restriktionerne ikke finde dem
2. Produktion af proteiner som inhiberer værtscelle restriktionsenzymer
3. Høj mutationsrate |
| Hvad er specielt ved en ssRNA (+) streng? | ssRNA (+) kan translateres direkte, da den er identisk med værtscellens mRNA |
| Hvad er specielt ved en ssRNA(-) streng | ssRNA(-)tilsvarer IKKE værtscellens mRNA (er komplimentær strengen til mRNA). Derfor må (-) strenget RNA først omdannes til (+) strenget RNA således at den er identisk med mRNA. Dette sker ved enzymet revers transkriptase. |
| Hvad er specielt ved ssRNA (+) retrovirus ? | ssRNA (+) retrovirus → bliver omdannet til dsDNA vha. Revers transkriptase |
| Hvad er specielt ved dsRNA? | dsRNA består af en (+) og (-) streng. (-) RNA strengen omdannes omskrives til mRNA. (+) strengen kan direkte translateres til protein (måske ikke rigtigt???) |
| Hvordan foregår replikationen af Viras DNA/RNA? | dsDNA og ssDNA kan replikeres på normal vis
Vira RNA replikation kræver det enzymet RNA replikase. Ved en (+) streng er det en af de første proteiner der bliver kodet for højst sandsynligt RNA replikase. Ved en (-) streng har de det med sig, da værstcellen aldrig har det i sig. |
| Hvad indebærer det humane mikrobiom? | alle de mikroorgasnismer man har på kroppen - hud, slimhinder, kønsorganer og tarmen |
| Hvordan gavner mikrobiomet helbredet? | - Bekæmpe patogene (bakterie, svampe og vira)
-Antimikrobielle stoffer (lantibiotics og bacteriociner)
-Udkonkurrerer om pladsen
-Omdanne fedtsyrer til kortkædede fedtsyrer så de kan optages over tarmen
- Producerer vitaminer som B_12 og K
- Syntese af aminosyrer vi ikke selv kan syntetiserer
- Stimulerer og ”uddanner immunforsvaret til at skelne mellem normalflora og patogene
- Danner humane neurotransmittere, der påvirker hormonelt og gavner humør |
| Hvordan er forholdet mellem humane celler og bakterier på kroppen | 10/1 mikroorgasnimer til humane celler |
| Hvor lever propioni bakterier? | Olieagtig hud (eks. ansigtet) |
| Hvor lever Coryne bakterier? | Fugtig hud. eks. under armene |
| Hvor lever Betaproteo bakterier | Tør hud (arme + ben) |
| Nævn karakteristika for mundens mikrobiota | Ingen dominerende slægt. Varierer fra person til person
Anaerobt etablering af visse bakterier fører til paradontose (syrennedbrydelse
Nitratreducerende og danner nitrit → oxytocin → sænker blodtrykket |
| Nævn karakteristika for tarmens mikrobiota | Bifidobacterium funktionel samspil mellem tarm og immunforsvaret (GUT-BRAIN AXIS)
Højt indhold af O_2 i starten af tarmen + maven og lavt i tyktarmen = fermenterende processer
Lavt pH i maven, men neutralt ved tyktarmen
Størst diversitet af bakterier i tyktarmen - Bacteroides = obligate anaerobe bakterier. Helicoibacter = kan give mavesår
Methanogener = øger optagelsen af næringstoffer. Overvægte har ofte flere |
| Nævn nogle vigtige bakterier i tarmen og hvad de gør | • Bifidobacterium funktionel samspil mellem tarm og immunforsvaret (GUT-BRAIN AXIS)
Bacteroides = obligate anaerobe bakterier.
Helicoibacter = kan give mavesår
• Methanogener = øger optagelsen af næringstoffer. Overvægte har ofte flere. |
| Hvad kendetegner kønsorganernes mikrobiota? | • Lactobacillus er dominerende i skeden
• Mikroboim overføres fra mor til barn ved vaginal fødsel |
| Hvad er specielt ved Enterococcus hirae | nogen har denne og det gør at man kan bruge immunterapi mod kræft |
| Hvad betyder homeostasis og dysbiosis? | Homeostasis = balance
Dysbiosis = ubalance →inflammation (IBD = inflammatory bowel disease) |
| Hvad betyder virulensfaktroer? | faktorer der gør en pathogen til en pathogen |
| Giv eksempler på virulensfaktorer / hvad der definerer en patogen: | - • Koloniserer/inficere værten
• Få fat i næring i kroppen
• Overleve angreb fra immunforsvar (Makrofager ”spiser” patogener):
• Sprede sig fra vært til vært |
| Uddyb hvad virulensfaktoren "kolonisering/inficering af værten: | Adhæsion → flagel, pili, fimbria, proteiner på bakteriens cellevæg, polysacchraid kapsel passer specifikt til receptorer på værtens epithelceller
Værtsspecifikt
Slimhinder, tarmepithel
Eks. på bakterier der benytter sig af polysaccharid kapsel - Bacillus antrcis (miltbrand) og Streptococcus pneumoniae
Få fat i næring i kroppen |
| Hvad gør enzymet hyaluronidase? | enzym bryder mellemrummet mellem epithelceller → nemmere passage |
| På hvilke måder kan patogene overleve immunforsvaret? | o Gemmer sig ved at have polysaccharidkapsel eller biofilm maskerer antigener. Biofilm = fysisk for stor til at blive opslugt af fagocytose
o Angribe vært med toxiner - Lysering af immunforsvarets celler |
| Hvad er kommensaler | Får næring fra værtens ydre og indre miljø, mens skader ikke værten- |
| Hvad er forskellen på sygdom og infektion? | Infektion = bevoksning af patogene bakterier på værten (bogens diffinition)
Sygdom = Når patogene bakterier lysere cellerne og der sker direkte skade |
| Hvad hedder det når patogene bakterier kommer ud i blodbanen og hvad kan det medføre? | Bakteriæmi. Kan medfører sepsis, hvor blodceller lyseres |
| Hvad hedder det når patogene vira kommer ud i blodbanen | Viræmi |
| Er toxiner varmetolerante? | Ja |
| Hvad er forskellen på exotoxiner og endotoxiner | Exotoxiner: (produceres og udskilles af bakterien
Endotoxiner: (frigives når bakterien lyserer) → mindre toxicitet |
| Hvad betyder attenuation? | Dæmpet eller tab af virulens for patogen, som følge af at vækstbetingelserne har været så gode at de ikke længere er nødvendige (eks. i lab) → bruges i vacciner |
| Giv eksempler på exotoxiner | • Cytotoxiner (lyserer humane celler)
• Neurotoxiner (påvirker nervesystemet)
• Enterotoxiner (påvirker tarmsystemet)
• Super-antigen toxiner (overstimulerer immunforsvaret)
• AB toxiner (=transporter + toxin. Target er altid intracellulært) |
| Giv eks. på en neurotexin udsendende bakterie? | Clostridium botulinum ”pølseforgiftning” → lammer muskelaturen |
| Giv eksempel på en enterotoxin udsendende bakterie: | Eks. Vibrio cholerae - trækker mere vand i tyktarmen = tynd mave |
| Hvad definerer en elektron donor? | Elektrondonor = et stof der AFGIVER elektroner ved en kemisk reaktion og bliver derved oxideret. |
| Giv eksempel på 3 elektrondonorer | H2S NH4+ CH4 |
| Hvad definerer en elektronaccepter? | Elektronacceptor = et stof der MODTAGER elektroner ved en kemisk reaktion og derved bliver reduceret |
| Giv 3 eksempler på elektronacceptor | O2, SO42- og CO2 |
| Hvad betyder det at et stof bliver oxideret? | Stoffet mister elektroner under reaktionen |
| Hvad betyder det at et stof bliver reduceret? | Stoffet modtager elektroner under reaktionen |
| Hvordan skal redoxpotentialet være før at der er tale om en elektrondonor? | Jo mere NEGATIVT et redoxpotentiale, desto bedre er stoffet som elektronDONOR |
| Hvordan skal redoxpotentialet være før at der tale om en elektronaccepter? | Jo mere POSITIVT et redoxpotentiale, desto bedre er stoffet som elektronACCEPTOR |
| Hvad har størst energiudbytte - respiration eller fermentering og hvorfor? | Respiration. Da forskellen i redoxpotentiale er større mellem glucose (donor) og O2 (accepter) ved respiration end mellem glucose og pyruvat ved fermentering |
| Hvad er fermenterende bakterier? | chemoorganoheterotrofe (kemisk energi som energikilde, organo= organisk energi som e-donor, heterotrof = Kan ikke selv fiksere CO2) |
| Hvad definerer kort sagt fermentering? | Ingen netto oxidation
Ingen ekstern elektronacceptor
ATP dannes ved substrat niveau fosforylering
Formål med fermentering er at danne energirige intermediater til at udfører substratniveau fosforylering |
| Hvilke typer af fermentering findes der: | Homofermentative
Hetereofermentative
MIxed acid fermentation |
| Hvad er forskellen på Homofermentative og
Hetereofermentative | Homofermentativ har aldolase, som som gør at pyruvat kan dannes mere direkte og der dannes 2 ATP. Heterofermentativ tager en stor omvej (Entner -Duodoroff pathway (glukose til 6-fosforgluconate), pentose fosfat pathway (dannelse af xylolose 5-fosfat og ethanol) og efterfølgende af embden-meyerhof (Glykolyse)) og danner ethanol og CO2 på vejen. Danner kun 1 ATP og ender også ud med laktat. |
| Hvor mange ATP dannes der ved fermentering og aerob respiration? | Fermentering: 3 ATP/glukose
Aerob respiration: 34-36 ATP i alt |
| Hvad lavede vi i lab som omhandlede fermenterende bakterier? | Sammenlignede fermenterende bakterier med nitrate-reducerende og sulfat-reducerende bakterier. Altså der i sidste led i deres elektrontransport kæde reducerer nitrat og sulfat i stedet for O_2.
Energy yield mellem de forskellige processor. Fermentering havde det laveste energiudbytte
pH for fermenteringsproccesen var omkring 5, da H^+ er biprodukt. Gør fermenterende bakterier en smule acidophile. |
| Hvad definerer Respiration? | Energi udvindes af kemiske stoffer (organiske eller uorganiske).
Kræver elektronacceptor,
det meste ATP dannes via. Protongradient (oxidativ fosforylering). |
| Hvad betyder kemoorganoheterotrof? | (kemo=kemisk energi som energikilde, organo= organisk energi som e-donor, heterotrof = Kan ikke selv fiksere CO2) |
| Hvad betyder Kemolithoautotof | = (kemo =kemisk energi som energikilde, litho= uorganisk energi som e-donor (CO_2). Autotrof = kan selv fikserer CO_2) |
| Hvad betyder Fotolithoautotrof | = (Foto = lysenergi som energikilde, litho= uorganisk energi som e-donor (CO_2). Autotrof = kan selv fikserer CO_2) |
| Hvad betyder Fotohetereotrof | (Foto = lysenergi som energikilde, heterotrof = Kan ikke selv fiksere CO2, men bruger organisk C som carbonkilde |
| Hvad betyder katabolisme og anabolisme? | Katabolisme = Energigivende processer, hvor energien udvindes af et stof
Anabolisme = Energikrævende processer. Energi udvundet ved de katabolkse processer bruges her. |
| Forklar kort hvilke trin både anaerob og aerob respiration gennemgår: | 1. 1. Glukose kataboliseres (nedbrydes) gennem glykolysen.
Organisk molekyle oxideres til energirigt intermediat ved at NAD+ reduceres til NADH
2. Pyruvat bliver fuldt oxideret til CO2 ved at NAD^+ reduceres til NADH igennem citronsyrecyklussen eller glyoxylate cyklussen.
3. ELektrontransportkæden. . ATP dannes både substratlevel fosforylering og oxidativ fosforylering. Der dannes i alt 38 ATP pr. glukose |
| Har bakterier mitokondrier? | NEJ! Husk at protongradienten dannes over cellemembranen |
| Hvad er forskellen på aerob og anerob respiration? | Aerob har O2 som sin ultimative elektronacceptor. dvs. O2 reduceres i sidste trin til H2O
Anaerob: har andre stoffer stom ultimative elektronacceptor. Eks. nitrat og sulfat. Kræver specifikke membranproteiner for at kunne reducere disse stoffer |
| Hvilken af sulfat eller nitrat er den bedste elektronacceptor? | Nitrat (E'=+0,40)
Sulfat er ret dårlig (E'=-0,22)
*vi har arbejdet med nitrat og sulfat reducerende bakterier i lab 2 |
| Hvad betyder Assimilativ | slutproduktet benyttes til biosyntese |
| Hvad betyder Dissimilativ | slutproduktet udskilles fra cellen |
| Hvad er specilet ved sulfat reduktion: sulfat->sulfit? | Energisk ufavorabel, kræver derfor aktivering i form af ATP |
| Hvilken forbindelse kan ikke fungerer som (biologisk) elektronacceptor?
- ammonium
- ilt
- sulfat
-kuldioxid
- nitrat | - Ammonium (er en elektrondonor) |
| Ved fermentation dannes ATP ved: | - Substratniveau fosforfylering (energirig binding brydes) |
| Hvorfor er det ikke muligt for en organisme at gro med glykolyse som eneste katabolske proces: | - NAD+ puljen udtømmes |
| Litotrofi involverer altid... | - En uorganisk elektron donor |
| Hvilken metabolsk gruppe mikroorganismer udnytter CO2 som elektron acceptor | Metanogener |
| HVilke to reaktioner er fotosyntesen opdelt i og hvad sker der? | - Lysreaktionen: producerer ATP ved oxidativ forsforylering
- Mørkereaktionen (Calvin cyklus): reducerer CO_2 til organisk materiale (biomasse/metabolisme) |
| Har bakterier kloroplaster som i planter? | NEJ! fotosyntesen sker i cellemembranen som kan vare foldet ind til lameller og vesikler |
| Hvad er specielt ved PSII? | Photosystem II er verdens bedste elektronaccepter og kan bruge H_2 O som elektrondonor |
| Hvilke 2 typer af fotoautotrofi findes der? | Oxygenisk = Danner oxygen → oxidation af H_2 O (donor) til O_2 (acceptor). Benytter både photosystem I og II
Anoxygenisk =Danner IKKE oxygen, men kan godt foregå steder med ilt → oxidation af f.eks. hydrogensulfid (donor) til elementær svivl/sulfat (accepter)
Bruger ENTEN photosystem I eller II |
| Hvilke bakterier er oxygeniske? | Cyanobakterier |
| Hvilke bakterier er anoxygeniske | Lilla svovl bakterier og grønne svovl bakterier |
| Hvilket fotosystem, bruger lilla svovl bakterier og hvad er specielt ved at bruge denne? | fotosystem II - kræver mere energi pga. revers elektronflow for at reducere NADP+ til NADPH |
| Hvilket fotosystem, bruger grønne svovl bakterier? | fotosystem I |
| Forklar kort hvad calvin cyklus går ud på og hvem bruger denne til co2 fiksering | fiksering af CO_(2 ) af Rubisco→ CO2 reduceres til sukkerstoffer. NDPH oxideres til NAD+ → regenering af RuBP
Cyanobakterier og lilla svovl bakterier |
| Forklar kort hvad revers CAC går ud på og hvem bruger denne til co2 fiksering | : 3 CO2 fikseres pr. cyklus og produktet er pyruvat, som kan bruges i biosyntese og dannelse af sukker fx ved reverse step i glykolyse →
ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
grønne svovl bakterier |
| Forklar kort hvad hydroxypropionat cyklus går ud på hvem bruger denne til co2 fiksering? | CO2 fikseres pa acetyl-CoA og produktet er glyoxylate, som kan omdannes til cellemateriale → ATP bruges til energi og NADH/NADPH/FADH bruges til reducing power
Grønne non-svovl bakterier |
| Hvad er fælles for kemolithoautotroferne: sulfid(H_2 S), ammonium (NH_4^+) og nitrit (NO_2^-) oxiderende mikroorganismer? | De gror langsomt og har lavt vækst udbytte fordi:
- De udnytter en ”dårlig” elektron donor. (se redoxtårnet)
- Sulfid, nitrit og ammonium kan ikke reducere NAD^+ til NADH
- De er autotrofer og skal bruge energi (ATP, NADH, revers e-flow) på assimimiliere CO_2 |
| Forklar svovl kredsløbet ultra kort: | 1. Dissimilatorisk sulfat reduktion: SO_4^(2-)→org.S→H_2 S - Reduceres, hvor slutprodukt er sulfid
2. Oxidation af sulfid til elementær svovl H_2 S→S^0. Sker aerob og anaerobt
3. Der kan ske to ting:
3aElementært svovl kan oxideres videre til sulfat SO_4^(2-)
3b Elementært svovl reduceres tilbage til sulfid S^0→H_2 S - sker anaerobt. - medieres af hyperthermophile archeaer |
| Hvad er sejt ved bakterien beggiotoa? | kæmpe svovl bakterier, som lever anaerobt i sedimentet. Oxiderer sulfid til sulfat: H_2 S→S^0→SO_4^(2-). Opkoncentrerer elementært svovl som korn inde i sig. |
| Forklar nitrogenkredsløbet ultra kort: | 1. N_2 frit i atmosfæren regnes ned på jorden
2. N_2 fikserende bakterier fikserer dette og REDUCERE det til NH_3
3. NH_3 oxideres til NO_2^- og videre til NO_3^- gennem nitrifikation vha. en række aerobe mikroorganismer
4. NO_3^- har to skæbner.
4.a optages i planter via. Rhizoider.
4.b gennemgå denitrifikation NO_3^-→N_2 REDUCERES og blive frigjort til atmosfæren |
| Hvordan arbejder ammonium oxiderende bakterier sammen med nitrit oxiderende bakterier? | Ammonium oxiderende bakterier oxiderer ammonium til nitrit
nitrit oxiderende bakterier oxiderer nitrit til nitrat
Den ene bruger den andens affaldsprodukt som substrat |
| Forklar carbon cyklus ultra kort | 1. atmosfærisk CO_2 bliver fikseret af planter og vandlevende mikroorganismer
2. CO_2 bliver REDUCERET til organisk stof
3. Organisk stof bliver OXIDERET til CO_2 igen for at danne ATP ved aerob, anerob reapiration
4. CO_2 og omdannelsen af dødt organisk materiale kan forekomme anaerobt på to måder:
4a.Fermentering: organisk stof → CO_2, acetate eller formate
4b. Methanogenesis: acetate / andet organisk stof reduceres til methan CH_4 |
| Hvad er methanogenesis? | foregår anaerobt. Donor: acetate eller andre carbon forbindelser. Acceptor: carbon → danner methan CH_4 |
| Forklar hvorfor nogle nitrit, ammonium og sulfid oxiderende bakterier benytter revers elektron flow og forklar hvad revers elektronflow er? | fordi sulfid, nitrit og ammonium ikke kan reducerer NAD^+ til NADH spontant, da NAD+/NADH har et mere negativt redoxpotenriale. De benytter så sig af revers elektronflow, hvor de aktivt sender elektroner den modsatte vej igennem elektrontransportkæden |
| Hvad er forskellen på cyklisk og non-cyklisk elektronflow? | Cyklisk elektronflow: Der er ingen eksterne elektroner der kommer ind komplekset. Elektronerne / elektrondonoerne er der allerede i systemet. Det er lysenergien der starter reaktionen ved at ekciterere -> danner energi. Går fra at være en god elektronacceptor til at være en god elektrondonor.
Non-cyklisk elektron flow: elektronen bruges til at fikserer CO2 |
