SEARCH
You are in browse mode. You must login to use MEMORY

   Log in to start

Mol.Bi.alapjai


🇭🇺
In Hungarian
Created:


Public
Created by:
Daddy


0 / 5  (0 ratings)



» To start learning, click login

1 / 25

[Front]


nukleázok hasítás helye szerint?
[Back]


exonukleáz és endonukleáz

Practice Known Questions

Stay up to date with your due questions

Complete 5 questions to enable practice

Exams

Exam: Test your skills

Test your skills in exam mode

Learn New Questions

Dynamic Modes

SmartIntelligent mix of all modes
CustomUse settings to weight dynamic modes

Manual Mode [BETA]

Select your own question and answer types
Specific modes

Learn with flashcards
Listening & SpellingSpelling: Type what you hear
multiple choiceMultiple choice mode
SpeakingAnswer with voice
Speaking & ListeningPractice pronunciation
TypingTyping only mode

Mol.Bi.alapjai - Leaderboard

1 user has completed this course

No users have played this course yet, be the first


Mol.Bi.alapjai - Details

Levels:

Questions:

114 questions
🇭🇺🇭🇺
Nukleázok hasítás helye szerint?
Exonukleáz és endonukleáz
Endonukleázok?
A nukleinsavak közbülső részein található foszfodiészter kötéseket tudják elhasítani
Ha a felismerési szekvencia metilálva van?
A restikciós enzim nem képes hasítani a DNS-t.
Nukleázok szubsztrát szál típusa szerint
Egyszálú vagy kétszálú DNS szubsztrát
Exonukleázok?
A DNS vagy RNS két végéről képesek nukleotidok eltávolítására
Nukleázok hasítás irányultsága szerint?
5’ -> 3’ vagy 3’ -> 5’
Nukleázok végződés típusa szerint?
3’ –OH vagy 5’ –OH végződés
I-es típusú restrikciós endonukleázok?
Restrikciós és metil-transzferáz aktivitással rendelkeznek három alegységből felépülő szerkezetük van Mg2+ szükséges a működésükhöz hasítóhelyük a felismerési helytől távol helyezkedik el
Hogyan védi a sejt a saját DNS-ét?
Restrikciós-modifikációs rendszerrel
II-es típusú restrikciós endonukleázok
Csak restrikciós funkcióval rendelkeznek működésükhöz Mg2+-ot igényelnek hasítóhelyük a felismerő helyben vagy annak közvetlen közelében található. felismerőhely általában 4-8 bázispár hosszúságú és jellemzően palindrom szekvencia meghatározott helyen hasítják a DNS-t, így az emésztés reprodukálható és a keletkezett termékek szekvenciája pontosan meghatározott lesz a restrikciós enzimek hasítóhelye eredményezhet ragadós véget vagy tompa véget
III-as típusú restrikciós endonukleázok
Hidrolizáló alegység és metiláló alegység Mg2+- függő enzimek hasítóhelyük a felismerési hely közelében található, nem palindrom
A DNS molekula végződését módosító enzimek
Polinukleotid kináz, alkalikus foszfatáz
Tompa végződés?
Egyes restrikciós endonukleázok a DNS mindkét szálát azonos pozícióban hasítják, rendszerint a felismerési szekvencia közepén.
DNS polimerázok
Olyan enzimek, amelyek egy létező DNS vagy RNS templátról szintetizálnak új, komplementer polinukleotid szálat.
Tapadós végződés?
Más restrikciós endonukleázok viszont szimmetrikusan, de nem középen hasítanak. Így rövid, egyszálú végződést alakítanak ki.
Restrikciós-modifikációs rendszernek két eleme
Egy restrikciós endonukleáz és egy annak megfelelő DNSmetiláz enzim.
Isoschizomerek
Azok az enzimeket, amelyeknél mind a felismerő, mind a hasítóhely egyforma
Ligázok
Olyan enzimek, amelyek nukleinsav molekulákat képesek összekapcsolni a nukleotidok közötti foszfodiészter kötés kialakításával.
Neoschizomerek
Azok az enzimek, amelyek felismerőhelye megegyezik, de hasítóhelyük különböző
Mire jó a metilálás?
Megvédi a DNS-t az endonukleáz hasításától.
S1-nukleáz
Aspergillus oryzae gombából származik olyan endonukleáz, amelyik egyszálú DNS-t vagy RNS-t képes lebontani kofaktora a Zn2+ pH optimuma a savas tartományban, 4.0-4.3 között van
Dezoxiribonukleáz (DNáz) I
Egy- és kétszálú DNS lebontására egyaránt képes maximális aktivitást kalcium-, magnézium- vagy mangán-ion jelenlétében mutat a DNáz aktivitás EDTA-val gátolható felhasználható például didezoxi- (Sanger-féle) szekvenáláskor jelölt DNS létrehozására hasadás-elmozdulás (nick translation) technikával fehérje vagy RNS preparátumok DNS-től való megtisztítására is az enzim része a Klenow fragmentum
A DNS polimerázok típusai?
Templát-függő DNS-polimerázok és templát-független DNS-polimerázok
Hogyan működnek a polimerázok?
DNS szál szintéziséhez szükséges egy rövid kétszálú szakasz, és így az új szál szintézise egy már meglevő 3’-végről indulhat 5’->3’ irányban a természetben az új szál szintézise mindig egy rövid RNS szakasszal, a primerrel indul gyakorlatban primerként általában egy rövid szintetikus oligonukleotid molekulát használnak, ami a templát DNS-hez kapcsolódva biztosítja a szükséges kétszálú szakaszt
A polimerázok képesek?
DNS szintézisére és láncbontásra
3’→5’-exonukleáz aktivitás
Az enzim a DNS szálon visszafelé haladva képes a már szintetizált nukleotidot eltávolítani  „proofreading“ vagy hibajavító aktivitásnak is nevezzük
5’→3’-exonukleáz aktivitás
Az enzim képes a láncon előre haladva az esetleg már ott található, a templáttal komplementer DNS szálat elbontani Okazaki fragmentumok esetén
DNS-polimeráz I és a Klenow-fragmentum
Minden prokariótában megtalálható fontos szerepe van a bakteriális genom replikációjában, eltávolítja az RNS primert a követő szálról és az Okazaki-fragmentumok összekötését végzi
Hőstabil DNS-polimerázok
Taq-polimeráz Pfu-polimeráz Phusion-polimeráz
Reverz transzkriptáz
RNS-függő DNS-polimeráz retrovírusok replikációs ciklusában játszanak szerepet a retrovírusok genomja RNS-ből áll, amiről DNS másolat készül a gazdaszervezet fertőzése után laboratóriumi gyakorlatban használható mRNS molekulákról DNS másolat készítésére (cDNS)
Terminális transzferáz
Homopolimer ragadós végek kialakítására használható templát-független DNS-polimeráz
Alkalikus foszfatáz
Hidrolázok közé tartozik DNS 5’ végéről távolítja el a foszfát csoportot plazmid vektorba való klónozás során az egyik lehetséges hibaforrás, hogy a felnyitott plazmid üresen ligálódik össze
T4 polinukleotid-kináz
Az ATP γ-foszfát csoportjának a DNS szabad 5’-hidroxil végére történő átvitelét katalizálja felhasználható oligonukleotidok, DNS vagy RNS 5’-végének jelölésére (γ - 32P) ATP használatával.
Mi a DNS ligázok in vivo szerepe?
Katalizálja a hiányzó foszfodiészter kötést
Emlősökben a DNS-ligázok négy típusa fordul elő, szerepük
Az Okazaki-fragmentumok összekapcsolásában különböző hibajavító mechanizmusokban, mint például a nukleotid-kivágással járó DNS hibajavítás, a kétszálú DNS törése és javítása
DNS ligáz in vitro szerepe?
Két törés létrejöttét katalizálja
Nukleázok
Olyan enzimek, amelyek a nukleinsavak nukleotid egységei közötti foszfodiészter kötést hasítják.
Mire jó a metilálás?
Megvédi a DNS-t az endonukleáz hasításától.
Restrikciós-modifikációs rendszernek két eleme
Egy restrikciós endonukleáz és egy annak megfelelő DNSmetiláz enzim.
Ha a felismerési szekvencia metilálva van?
A restikciós enzim nem képes hasítani a DNS-t.
Milyen anyagokat használunk extrahálásnál?
Fenol, kloroform, izoamilalkohol
Mi az ioncserés kromatográfia?
Kül. töltésű molekulák töltésük szerinti elválasztása
Agaróz gélelektroforézis célja?
DNS molekulák méretük alapján történő szeparálása
Mi a klónozó vektor?
Olyan DNS molekula amelybe idegen DNS fragmentum építhető be
Mi a rekombináns vektor?
Idegen DNS inzertet tart. vektor DNS
Klónozó vektor típusai?
Plazmid, kozmid, bakteriofág
Mi a plazmid vektor?
Extrakromoszómális, önálló replikációra képes, cirkuláris
Mi a kozmid vektor?
Plazmid és lambda fág kombinációja
Mi a bakteriofág vektor?
Lineáris , nagyobb hatékonyságú
Mi a transzformálás?
Egy rekombináns plazmidot E.coli sejtbe juttatunk
Antibiotikum hatása?
Gátolja a sejtfal, sejtmembrán, fehérje és nukleinsav szintézist
Mi a Lac Z?
Lac operon része, béta galaktozidázt kódol ami a laktózt glukózra és galaktózra bontja
Mi a DNS könyvtár?
Reprezentatív DNS fragmentumok önálló replikációra képes vektorba klónozott gyűjteménye, amely a megfelelő gazdasejtben szaporítható
Mi a cDNS?
Reverz transzkriptáz enzim segítségével készült DNS kópia mRNS molekuláról
Mit tartalmaznak a genomi DNS könytárak?
DNS fragmentumok gyűjteménye
Mit tartalmaznak a cDNS könyvtárak?
Érett mRNS szekvenciáról készült komplementer szálakat
Mi a Souther blot?
DNS analízis
Mi a Norther blot?
RNS analízis
RNS próbánál mibe klónozzák a jelölendő szekvenciát?
Fág promóterek között elhelyezkedő poli-klónozó hely
Mitől függ az ECL?
Western blot olyan enzim szub-tal való inkubálásától, amely képes reakcióba lépni a szondával és így képes láthatóvá tenni a fehérjét
Mi a transzkriptom?
Egy adott sejtben kifejeződő, transzkripcióra kerülő gének összessége
Mire használható a microarray?
Génexpresszió relatív mérése, SNP detektálás, genomok összehaszonlítása
Mi a DNS chip?
Kis cellákra osztott lapocska, amelyekben ugyanannak az organizmusnak egy egy génjét v. génvariánsát tartalmazó oligonukleotidok vannak
Affimatrix microarray kivitelezése?
Fotolitográfiával állítják elő és üveg lapon szintetizálják meg az egyszálú DNS t
Mi a klasszikus citogenetika?
Giemsa festést követően a krom.-k jellegzetes sávozása
Mire alkalmas a FISH?
Ismert eltérések kimutatására
Mire alkalmas a CGH?
Ismert és ismeretlen kromoszómális genetikai eltérések kimutatására
Mi a FISH?
Próba-DNS szekvenciákat kapcsolnak target DNS mintához, melyek fluoreszcens molekulákat tartalmaznak
Mi a próba DNS?
Fluorokrómmal módosított duplaszálú DNS
DNS hibridizációt befolyásoló tényezők?
Hőm, ionerősség, pH, denaturáló oldószer, DNS fragmentek, mosási körülmények
Hibridizációs elegy komponensei?
50-55% formamid, 2x SSC, 10% dextrát szulfát